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淺談基于一致性法的肺部CT圖像血管提取
論文摘要:在肺部CT圖像中,血管與背景的對(duì)比度較低,很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié)。為了解決這個(gè)問題,本文提出具有旋轉(zhuǎn)不變性的一致性法。根據(jù)肺部CT影像細(xì)小血管具有局部亮度和結(jié)構(gòu)光滑的紋理特征檢測(cè)細(xì)小血管。首先采用OTSU等算法快速定位CT圖像的肺部區(qū)域并對(duì)定位出的結(jié)果進(jìn)行去噪,應(yīng)用圖像二值化方法分割出粗大血管,然后對(duì)沒有粗大血管肺部區(qū)域的各個(gè)子區(qū)域采用一致性法進(jìn)行分類計(jì)算,最后根據(jù)細(xì)小血管的紋理特征值使用支持向量機(jī)對(duì)有細(xì)小血管的子區(qū)域及有肺結(jié)節(jié)的子區(qū)域進(jìn)行樣本訓(xùn)練,判斷是否是細(xì)小血管然后將其提取。實(shí)驗(yàn)說明該方法是有效的。
論文關(guān)鍵詞:肺部,圖像,一致性法,紋理特征,支持向量機(jī)
  0引言
  隨著CT掃描技術(shù)的發(fā)展,針對(duì)肺部疾病的診斷,越來越廣泛使用肺部CT計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)(CAD),在肺部CT疾病眾多,如肺栓塞,肺結(jié)節(jié)等,應(yīng)用計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)對(duì)這些疾病進(jìn)行早期診斷達(dá)到早期治療的目的是最好的解決辦法。對(duì)于早期腫瘤以及與肺血管粘連的腫瘤,往往很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié),因此計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)對(duì)這種腫瘤的識(shí)別率較低。
  1相關(guān)工作
  在肺部CT圖像中,血管與背景的對(duì)比度較低,很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié)。為了解決這個(gè)問題,根據(jù)肺部CT影像細(xì)小血管具有局部亮度和結(jié)構(gòu)光滑的紋理特征檢測(cè)細(xì)小血管。本文的算法是能夠提取具有旋轉(zhuǎn)不變性的紋理特征來實(shí)現(xiàn)血管提取。局部二進(jìn)制模式是一種有效的紋理描述算子,由于其對(duì)圖像局部紋理特征的卓越描繪能力而獲得了廣泛的運(yùn)用。LBP是子區(qū)域中3×3中心像素閾值相對(duì)于相鄰像素值生成二進(jìn)制代碼的算法。如果相鄰的像素值比中心像素的小,它產(chǎn)生一個(gè)二進(jìn)制代碼0,否則,它會(huì)生成一個(gè)二進(jìn)制代碼1。這些二進(jìn)制代碼乘以相應(yīng)的權(quán)便可得出LBP生成的代碼,其計(jì)算方法如下:
  其中(x,y)是中心點(diǎn)位置,g是中心點(diǎn)像素值,g中心點(diǎn)相鄰像素點(diǎn)的像素值,P是中心點(diǎn)相鄰像素點(diǎn)個(gè)數(shù),R為半徑
  
  為了突出旋轉(zhuǎn)不變特性,將LBP擴(kuò)展為一個(gè)圓形“統(tǒng)一”模型,八個(gè)相鄰像素點(diǎn)組成一個(gè)半徑為R的圓形區(qū)域。該方法方便計(jì)算,但相鄰像素灰度值不一定與該像素位置完全符合。這種旋轉(zhuǎn)不變的LBP可以計(jì)算如下:
  
  
  參數(shù)U是用來估計(jì)對(duì)應(yīng)于空間過渡的一致性,即二進(jìn)制數(shù)按位0、1之間變化的次數(shù)。因此,U的值越大,局部區(qū)域亮度發(fā)生轉(zhuǎn)變?cè)蕉。圖1是一個(gè)圓環(huán)“統(tǒng)一”模型。
  
  圖1.一個(gè)統(tǒng)一模型中不同U值的情況
  考慮到肺部CT影像的復(fù)雜結(jié)構(gòu),干擾噪聲,本文提出重新定義方程(3)~(5)如下:
  
  
  
  從式子(7)可以看出,在本文中心點(diǎn)像素與周邊像素之間亮度的關(guān)系有三種情況。不同的結(jié)果(-1,0和1)代表了不同的情況。本文提出這種新的模式可以分清中心點(diǎn)和更細(xì)節(jié)的相鄰像素亮度的關(guān)系。
  2特征系統(tǒng)的提取
  要提取紋理特征,并識(shí)別肺部的正常血管區(qū)域和病變區(qū)域。必須先定位CT圖像中的肺部區(qū)域,并對(duì)它進(jìn)行相應(yīng)的處理。
  2.1肺部區(qū)域的定位
  根據(jù)肺部CT圖像的影像學(xué)和解剖學(xué)特點(diǎn),首先利用最大類間方差法(OTSU法)對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)分割,然后利用區(qū)域生長及小面積消除方法剔除干擾信息,同時(shí)生成掩模圖像,最后運(yùn)用數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)方法對(duì)模板進(jìn)行細(xì)化,將原始圖像與掩模圖像進(jìn)行數(shù)學(xué)運(yùn)算即可得到肺部區(qū)域。
  2.1.1快速分割算法
  本文利用大量圖像進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),在此以一幅正常的肺部CT圖像為例。利用OTSU法預(yù)分割得到的結(jié)果如圖2。
  
  圖2.肺部CT圖像OTSU法分割結(jié)果
  經(jīng)過OTSU法分割后,肺部CT圖像根據(jù)灰度值分布情況將肺部區(qū)域和背景大致分開,但是圖像中還存在檢查床、心臟和血管等高密度區(qū)域都會(huì)對(duì)提取完整的肺部區(qū)域形成干擾,為了去除這些無關(guān)信息,我們利用基于區(qū)域生長的方法和小面積計(jì)算的方法繼續(xù)進(jìn)行分割。
  經(jīng)過區(qū)域生長再分割和反色變換后得到的圖像如圖所示。除了大部分肺部組織外,氣管、支氣管因內(nèi)部充滿空氣,也顯示為低密度影區(qū),而原本屬于肺部組織的部分血管、結(jié)節(jié)、纖維化等則顯示為高密度影區(qū)。我們分別對(duì)圖像的兩個(gè)密度區(qū)域進(jìn)行連通域標(biāo)記,測(cè)得各連通區(qū)域的面積,同時(shí)選取合適的面積閾值,并對(duì)面積小于相應(yīng)閾值的區(qū)域內(nèi)的像素值取反,從而彌補(bǔ)二值化過程帶來的分類誤差。
  通過上述一系列的處理,肺部模板已經(jīng)基本成形,但是,對(duì)圖進(jìn)行分析可以看到,由于肺實(shí)質(zhì)邊緣密度和周圍組織非常相近,在肺部區(qū)域預(yù)分割時(shí)常常將其誤分為背景,因此,本文利用形態(tài)學(xué)的閉運(yùn)算對(duì)模板進(jìn)行細(xì)化。圖3(a)為利用閉運(yùn)算細(xì)化得到的最終模板,將原圖與模板做減運(yùn)算即得到了肺部區(qū)域的完整圖像,如圖3(b)所示。
  
  (a)模板細(xì)化結(jié)果(b)肺部區(qū)域像
  圖3.分割最終結(jié)果
  2.1.2初步定位并剔除粗血管
  先通過直方圖均衡化提高上面得到的肺部區(qū)域圖像的對(duì)比度,然后將圖片二值化,就得到了粗血管,如圖4(a)。通過圖4(a)找出的粗血管圖,映射到原圖,將粗血管區(qū)域剔除掉。圖4(b)為剔除粗血管后的肺部區(qū)域。
  
 。╝)找出的粗血管圖(b)剔除粗血管后的圖像
  圖4.剔除肺部區(qū)域粗血管
  把最后對(duì)得到的圖片進(jìn)行分割,分成若干個(gè)25*25(單位:像素)的子區(qū)域。接下來的工作只對(duì)肺部區(qū)域占70%以上的小區(qū)域進(jìn)行處理。在接下來的步驟中,沒有粗血管的肺部區(qū)域被分成子區(qū)域。對(duì)于每個(gè)子區(qū)域,我們計(jì)算了基于灰度的NLBP值后計(jì)算梯度方向差,以得出條件概率密度函數(shù),進(jìn)行6個(gè)紋理特征量的計(jì)算。最后,根據(jù)6個(gè)紋理特征量使用支持向量機(jī)(SVM)對(duì)子區(qū)域進(jìn)行分類。
  \
  2.2肺部紋理特征提取
  本文對(duì)GLCM方法進(jìn)行改進(jìn),提出新的不依賴角度具有旋轉(zhuǎn)不變性的一致性法。
  
  圖5.中心點(diǎn)的梯度方向
  設(shè)圖像強(qiáng)度函數(shù)為S(x,y),計(jì)算點(diǎn)P(x,y)梯度方向如下:
  (10)
  如公式(10)所示,梯度方向表示點(diǎn)P(x,y)的局部結(jié)構(gòu)。圖5表示中心點(diǎn)梯度方向?梢钥闯鎏荻确较蛉Q于中心點(diǎn)周圍的局部結(jié)構(gòu)。在這種情況下,盡管這兩中心點(diǎn)的NLBP值相同,但其梯度方向是不同的。因此,本文提出計(jì)算兩點(diǎn)之間的梯度方向的差異,以評(píng)估其局部結(jié)構(gòu)的相似性。圖6中箭頭表示模型各點(diǎn)的梯度方向的差異。
  0
  圖6.梯度方向的差異
  因此,點(diǎn)P(x,y)和它的各鄰點(diǎn)P(x,y)之間的梯度差可通過以下計(jì)算得到:(11)
  可知點(diǎn)P(x,y)的灰度值表示它的亮度,NLBP值表示點(diǎn)P(x,y)周圍的亮度均勻性,以及梯度方向差異表示點(diǎn)P(x,y)局部結(jié)構(gòu)的均勻性。假設(shè)鄰點(diǎn)的個(gè)數(shù)為N,半徑為R,鄰點(diǎn)坐標(biāo)分別為P(x,y),P(x,y),…,P(x,y),定義一個(gè)基于給定點(diǎn)P(x,y)與它的鄰點(diǎn)P(x,y)之間的一致性如下:
  (12)
  其中g(shù)是點(diǎn)P(x,y)的灰度值。同理,以P(x,y),P(x,y),…,P(x,y)的值為基礎(chǔ)通過公式(12)求得一致性。GNLBP是灰度值和NLBP的組合。因此,如果P(x,y)周圍點(diǎn)灰度值均勻,那么GNLBP值較低。通過公式(12)定義條件概率密度函數(shù)f(GNLBP,GOD|N,R),其中0≤GNLBP(假設(shè)灰度值范圍是0~L),0≤GOD假設(shè)梯度方向差的范圍是0~D),最后,通過函數(shù)f(GNLBP,GOD|N,R)得到大小為L*D的矩陣如下:
  (13)
  本文提出的這種方法能夠代表局部亮度和結(jié)構(gòu)均勻性,稱其為一致性法。定義以下6個(gè)紋理特征來分析CT圖像。
  1)熵(ENT):
  (14)
  2)梯度方向均勻性(GOUE):
  (15)
  3)梯度方向非均勻性(GODE):
  (16)
  4)方差(VAR):
  (17)
  5)灰度均質(zhì)性(GLUH):
  (18)
  6)灰度均勻程度(GLUE):
  (19)
  3實(shí)驗(yàn)結(jié)果
  3.1圖像信息
  采用醫(yī)院提供的15例肺部CT圖像做為實(shí)驗(yàn)圖像,包括5例正常肺組織(NL,433張圖片)樣本,5例小葉中心型肺氣腫(CLE,433張圖片)樣本,5例肺結(jié)節(jié)(LN,433張圖片)樣本。這些圖像的切片厚度都是5mm,以BMP圖片格式來存儲(chǔ),每個(gè)像素有256級(jí)灰度。表1是CT圖像資料信息。
  表1CT圖像的信息
  Table1.InformationofCTimages
  

分辨率

1024 * 1024

切片

5毫米/

文件格式

BMP

設(shè)置類型

肺設(shè)置

灰度

256


  3.2圖像識(shí)別效果
  計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)(CAD)的最后階段是要實(shí)現(xiàn)機(jī)器識(shí)別分類醫(yī)學(xué)圖像的疾病。近年來,支持向量機(jī)(SVM)已被公認(rèn)為是一種有效的模式識(shí)別方法。它在人臉識(shí)別,文本分類等領(lǐng)域均有應(yīng)用。
  經(jīng)過前面的處理,已經(jīng)提取了肺部CT中較粗的血管,接下來使用支持向量機(jī)(SVM)來對(duì)肺部CT圖像中的細(xì)小血管進(jìn)行識(shí)別。為了評(píng)價(jià)該方法的性能,本文使用了在第3節(jié)所述紋理特征量作為特征向量。
  根據(jù)前面得到的圖像特征,可以對(duì)肺部CT圖像進(jìn)行血管識(shí)別,識(shí)別結(jié)果見表2
  表2.肺部CT細(xì)小血管識(shí)別結(jié)果
  

組別

正常肺部CT圖像

肺結(jié)節(jié)CT圖像

肺氣腫CT圖像

1

正確率(%

94.0

89.5

93.5

2

正確率(%

91.5

90.5

92.5

3

正確率(%

90.5

90.5

91.5

4

正確率(%

94.5

89.2

93.5

5

正確率(%

93.5

89.0

90.5

根據(jù)識(shí)別的結(jié)果,剔除細(xì)小血管的圖像,效果如圖7。
  
  圖7.提取的血管圖像
  4結(jié)論
  在醫(yī)學(xué)圖像處理中,紋理特征是最流行的一種特征分析方法。文章的目的是更精確地提取肺部CT圖片的血管。本文提出一種新的紋理提取方法,采用一致性法根據(jù)肺部CT影像血管具有局部亮度和結(jié)構(gòu)光滑的特征檢測(cè)血管的紋理變化。通過計(jì)算得到肺部CT血管紋理特征的六個(gè)特征量ENT、GOUE、GODE、VAR、GLUH、GLUE。把樣本的這六個(gè)紋理特征量載入向量機(jī)進(jìn)行訓(xùn)練,得到細(xì)小血管的識(shí)別模型,利用這個(gè)本文提出的模型對(duì)著對(duì)肺部CT細(xì)小血管進(jìn)行識(shí)別,篩選出含細(xì)小血管肺部CT圖像。利用本文的血管提取算法,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示識(shí)別的平均正確率在90%以上。
  由于肺部血管結(jié)構(gòu)復(fù)雜,我們沒有對(duì)所有病例的肺部CT圖片進(jìn)行血管提取,只選用了正常肺部、肺結(jié)節(jié)、肺氣腫CT圖做實(shí)驗(yàn),今后要對(duì)更多的病例圖片進(jìn)行識(shí)別處理,完善識(shí)別算法,不斷提高識(shí)別精度及減少計(jì)算復(fù)雜度。
參考文獻(xiàn)
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