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淺談基于一致性法的肺部CT圖像血管提取

摘要:在肺部CT圖像中,血管與背景的對比度較低,很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié)。為了解決這個問題,本文提出具有旋轉(zhuǎn)不變性的一致性法。根據(jù)肺部CT影像細小血管具有局部亮度和結(jié)構(gòu)光滑的紋理特征檢測細小血管。首先采用OTSU等算法快速定位CT圖像的肺部區(qū)域并對定位出的結(jié)果進行去噪,應(yīng)用圖像二值化方法分割出粗大血管,然后對沒有粗大血管肺部區(qū)域的各個子區(qū)域采用一致性法進行分類計算,最后根據(jù)細小血管的紋理特征值使用支持向量機對有細小血管的子區(qū)域及有肺結(jié)節(jié)的子區(qū)域進行樣本訓(xùn)練,判斷是否是細小血管然后將其提取。實驗說明該方法是有效的。
論文關(guān)鍵詞:肺部CT圖像,一致性法,OTSU,紋理特征,支持向量機
  隨著CT掃描技術(shù)的發(fā)展,針對肺部疾病的診斷,越來越廣泛使用肺部CT計算機輔助診斷系統(tǒng)(CAD)[1,2,3,4], 在肺部CT疾病眾多,如肺栓塞,肺結(jié)節(jié)等,應(yīng)用計算機輔助診斷系統(tǒng)對這些疾病進行早期診斷達到早期治療的目的是最好的解決辦法[5,6,7]。對于早期腫瘤以及與肺血管粘連的腫瘤, 往往很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié), 因此計算機輔助診斷系統(tǒng)對這種腫瘤的識別率較低。
  現(xiàn)有的血管提取方法包括閾值法和增強血管象素平衡法及跟蹤算法。閾值方法簡單易行, 但是鑒于肺部CT 圖像中血管與背景的低對比度, 因此提取效果不理想。象素平衡法將力學(xué)平衡的觀點引入象素灰度中, 給出了象素平衡計算公式, 當(dāng)圖像中所有象素均平衡時, 整幅圖像平衡, 此時圖像中目標(biāo)與背景對比度最大。象素平衡法大量采用公式迭代運算, 計算量較大, 因此不適用于數(shù)據(jù)量較大的CT 圖像。跟蹤算法是在閾值細化方法處理后, 以檢測出的血管為基礎(chǔ), 利用血管與背景梯度信息跟蹤檢測出在閾值細化方法中漏檢的血管。采用OTSU 算法二值化肺部CT 圖像, 形態(tài)學(xué)細化算法提取血管骨架, 依據(jù)血管光滑性確定跟蹤方向并根據(jù)灰度梯度信息跟蹤出更多的細小血管,跟蹤算法是從單一方向進行跟蹤, 而血管有很多分支, 并不是單一方向的, 因此還可以考慮從多個方向進行跟蹤,所以該算法還有待進一步改善和提高。
  本文的研究目的是快速提取肺部CT圖像的大血管,然后針對細小血管與肺結(jié)節(jié)及腫瘤的紋理特征進行診斷與提取。根據(jù)研究動機,本文提出了一個新的特征提取系統(tǒng)即一致性法用于檢測肺部大血管及細小血管。運用于肺部子區(qū)域的紋理特征信息精確診斷提取肺部的血管,大大提高肺部細小血管的提取的精確性,提高了肺部疾病的早期診斷的準(zhǔn)確性。
  1相關(guān)工作
  在肺部CT圖像中,血管與背景的對比度較低,很難分辨腫瘤和血管結(jié)節(jié)。為了解決這個問題,根據(jù)肺部CT影像細小血管具有局部亮度和結(jié)構(gòu)光滑的紋理特征檢測細小血管。本文的算法是能夠提取具有旋轉(zhuǎn)不變性的紋理特征來實現(xiàn)血管提取。局部二進制模式是一種有效的紋理描述算子,由于其對圖像局部紋理特征的卓越描繪能力而獲得了廣泛的運用。LBP[10,11]是子區(qū)域中3 × 3中心像素閾值相對于相鄰像素值生成二進制代碼的算法。如果相鄰的像素值比中心像素的小,它產(chǎn)生一個二進制代碼0,否則,它會生成一個二進制代碼1。這些二進制代碼乘以相應(yīng)的權(quán)便可得出LBP生成的代碼,其計算方法如下:
  支持向量機
  其中(xc, yc)是中心點位置,gc是中心點像素值,gp中心點相鄰像素點的像素值,P是中心點相鄰像素點個數(shù),R為半徑
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取
  圖1顯示了一個LBP代碼產(chǎn)生的過程。
  肺部CT圖像
  圖1. LBP代碼生成過程
  Figure.1 The generation process of LBP code
  為了突出旋轉(zhuǎn)不變特性,將LBP擴展為一個圓形“統(tǒng)一”模型[10],八個相鄰像素點組成一個半徑為R的圓形區(qū)域。該方法方便計算,但相鄰像素灰度值不一定與該像素位置完全符合。這種旋轉(zhuǎn)不變的LBP可以計算如下:
  一致性法
  一致性法
  紋理特征參數(shù)U是用來估計對應(yīng)于空間過渡的一致性,即二進制數(shù)按位0、1之間變化的次數(shù)。因此,U的值越大,局部區(qū)域亮度發(fā)生轉(zhuǎn)變越多。圖2是一個圓環(huán)“統(tǒng)一”模型。
  OTSU
  圖2. 一個統(tǒng)一模型中不同U值的情況
  Figure.2 A uniformity model of different U-values
  考慮到肺部CT影像的復(fù)雜結(jié)構(gòu),干擾噪聲,本文提出重新定義方程(3)~(5)如下:
  支持向量機
  OTSU
  OTSU
  從式子(7)可以看出,在本文中心點像素與周邊像素之間亮度的關(guān)系有三種情況。不同的結(jié)果(-1,0和1)代表了不同的情況。本文提出這種新的模式可以分清中心點和更細節(jié)的相鄰像素亮度的關(guān)系。與LBP相比,本文定義的NLBP在估計亮度均勻性具有更好的效果,同時具有旋轉(zhuǎn)不變性。
  2 特征系統(tǒng)的提取
  要提取紋理特征,并識別肺部的正常血管區(qū)域和病變區(qū)域。必須先定位CT圖像中的肺部區(qū)域,并對它進行相應(yīng)的處理。
  2.1 肺部區(qū)域的定位
  根據(jù)肺部CT圖像的影像學(xué)和解剖學(xué)特點,首先利用最大類間方差法(OTSU 法)對圖像進行預(yù)分割,然后利用區(qū)域生長及小面積消除方法剔除干擾信息,同時生成掩模圖像,最后運用數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)方法對模板進行細化,將原始圖像與掩模圖像進行數(shù)學(xué)運算即可得到肺部區(qū)域。具體方法如圖 3 所示。
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取
  圖3 肺部區(qū)域提取示意圖
  Figure.3 The steps of lung region location phase
  2.1.1 快速分割算法
  最大類間方差法由日本學(xué)者Nobuyuki Otsu[8]首先提出,是一種自適應(yīng)的閾值確定方法,又叫大津法,簡稱 OTSU 法。該方法應(yīng)用類判別法尋找最佳閾值,以獲得最好的分離特性。利用 OTSU 法依據(jù)類間距離極大準(zhǔn)則來確定區(qū)域分割閾值就意味著錯分概率最小。
  本文利用大量圖像進行了實驗,在此以一幅正常的肺部CT圖像為例。圖4(a)為原始圖像,(b) 為利用 OTSU 法預(yù)分割得到的結(jié)果。
  紋理特征紋理特征
  (a) 肺部CT圖像 (b) OTSU法分割結(jié)果
  (a)Lung CT image (b) enhanced image
  圖4 肺部CT圖像OTSU法分割結(jié)果
  Figure.4 Lung CT image after OTSU enhancement
  經(jīng)過 OTSU 法分割后,肺部CT圖像根據(jù)灰度值分布情況將肺部區(qū)域和背景大致分開,但是圖像中還存在檢查床、心臟和血管等高密度區(qū)域都會對提取完整的肺部區(qū)域形成干擾,為了去除這些無關(guān)信息,我們利用基于區(qū)域生長的方法和小面積計算的方法繼續(xù)進行分割?梢杂脠D 5表示。
  一致性法
  圖5. 區(qū)域生長流程圖
  Figure.5 Flow diagram of adaptive threshold
  經(jīng)過區(qū)域生長再分割和反色變換后得到的圖像如圖 6(a) 所示。除了大部分肺部組織外,氣管、支氣管因內(nèi)部充滿空氣,也顯示為低密度影區(qū),而原本屬于肺部組織的部分血管、結(jié)節(jié)、纖維化等則顯示為高密度影區(qū)。我們分別對圖像的兩個密度區(qū)域進行連通域標(biāo)記,測得各連通區(qū)域的面積,同時選取合適的面積閾值,并對面積小于相應(yīng)閾值的區(qū)域內(nèi)的像素值取反,從而彌補二值化過程帶來的分類誤差。處理結(jié)果如圖 6(b) 所示。
  支持向量機紋理特征
  (a) 區(qū)域生長結(jié)果 (b) 小面積消除結(jié)果
  圖6. 去除無關(guān)信息的結(jié)果
  Figure.6 Images after adaptive threshold
  通過上述一系列的處理, 肺部模板已經(jīng)基本成形, 但是,對圖 6(b) 進行分析可以看到,由于肺實質(zhì)邊緣密度和周圍組織非常相近,在肺部區(qū)域預(yù)分割時常常將其誤分為背景,因此,本文利用形態(tài)學(xué)的閉運算對模板進行細化。圖7(a) 為利用閉運算細化得到的最終模板,將原圖與模板做減運算即得到了肺部區(qū)域的完整圖像,如圖 7(b) 所示。
  一致性法一致性法
  (a) 模板細化結(jié)果 (b) 肺部區(qū)域像
  (a) Image after the morphology process (b)Image of Lung region
  圖7. 分割最終結(jié)果
  Figure7. Image result
  2.1.2 初步定位并剔除粗血管
  先通過直方圖均衡化提高上面得到的肺部區(qū)域圖像的對比度,然后將圖片二值化,就得到了粗血管,如圖8(a)。通過圖8(a)找出的粗血管圖,映射到原圖,將粗血管區(qū)域剔除掉。圖8(b)為剔除粗血管后的肺部區(qū)域。
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取支持向量機
 。╝)找出的粗血管圖 (b)剔除粗血管后的圖像
 。╝)the vessels (b)Lung region without vessels
  圖8.剔除肺部區(qū)域粗血管
  Figure 9. Lung region image without big vessels
  把最后對得到的圖片進行分割,如圖9所示,分成若干個25*25(單位:像素)的子區(qū)域。接下來的工作只對肺部區(qū)域占70%以上的小區(qū)域進行處理。在接下來的步驟中,沒有粗血管的肺部區(qū)域被分成子區(qū)域。對于每個子區(qū)域,我們計算了基于灰度的NLBP值后計算梯度方向差,以得出條件概率密度函數(shù),進行6個紋理特征量的計算。最后,根據(jù)6個紋理特征量使用支持向量機(SVM)對子區(qū)域進行分類 。
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取
  圖9. 對沒有粗大血管的肺部區(qū)域進行分割
  Figure 9. Sub-regions of the lung without big vessels
  2.2 肺部紋理特征提取
  NLBP能夠描述中心像素與其鄰邊區(qū)域灰度值的關(guān)系,但是它不能說明這些血管像素光滑的局部結(jié)構(gòu)信息。圖10(a)和(b)是樣品圖像中兩個3 × 3的局部區(qū)域模型。我們可以看到這兩種模式的NLBP值是相同的,然而這兩種模式的局部構(gòu)造是不同的。
  描述血管像素光滑的局部結(jié)構(gòu),提取紋理特征的有效性方面,統(tǒng)計家族GLCM方法是公認(rèn)的有效方法,具有較強的適應(yīng)能力和魯棒性。該方法是建立在估計圖像的二階組合條件概率密度基礎(chǔ)上的。GLCM是描述在θ方向上, 相隔d像元距離的一對像元分別具有灰度層i和j的出現(xiàn)概率。顯然GLCM是一個對稱矩陣,是距離和方向的函數(shù), 其階數(shù)由圖像中的灰度級Ng 決定。盡管由GLCM提取的紋理特征具有較好的鑒別能力,但是這個方法在正確率依賴角度θ的選擇。
  本文對GLCM方法進行改進,提出新的不依賴角度具有旋轉(zhuǎn)不變性的一致性法。
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取
 。╝)
  紋理特征
  (b)
  圖10. 中心點的梯度方向
  Figure 10.The center gradient orientation
  設(shè)圖像強度函數(shù)為S(x,y),計算點P(x,y)梯度方向如下:
  一致性法(10)
  如公式(10)所示,梯度方向表示點P(x,y)的局部結(jié)構(gòu)。圖10(a)和(b)表示兩個中心點梯度方向?梢钥闯鎏荻确较蛉Q于中心點周圍的局部結(jié)構(gòu)。在這種情況下,盡管這兩中心點的NLBP值相同,但其梯度方向是不同的。因此,本文提出計算兩點之間的梯度方向的差異,以評估其局部結(jié)構(gòu)的相似性。圖11中箭頭表示模型各點的梯度方向的差異。
  支持向量機
  圖11. 梯度方向的差異
  Figure 11. Gradient orientation differences
  因此,點P(x,y) 和它的各鄰點 P (xn, yn)之間的梯度差可通過以下計算得到:一致性法(11)
  可知點P(x,y)的灰度值表示它的亮度,NLBP值表示點P(x,y)周圍的亮度均勻性,以及梯度方向差異表示點P(x,y)局部結(jié)構(gòu)的均勻性。假設(shè)鄰點的個數(shù)為N,半徑為R,鄰點坐標(biāo)分別為P(x1,y1),P(x2,y2),…,P(xn,yn),定義一個基于給定點P(x,y)與它的鄰點P(x1,y1)之間的一致性如下:
  基于一致性法的肺部CT圖像血管提取(12)
  其中g(shù)c是點P(x,y)的灰度值。同理, 以P(x1,y1),P(x2,y2),…,P(xn,yn)的值為基礎(chǔ)通過公式(12)求得一致性。GNLBP是灰度值和NLBP的組合。因此,如果P(x,y)周圍點灰度值均勻,那么GNLBP值較低。通過公式(12)定義條件概率密度函數(shù)f(GNLBP,GOD|N,R),其中0≤GNLBP

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